Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms