Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms