Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms