Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms