Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms