Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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