Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms