Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms