Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms