Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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