Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo2Q9D8S4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms