Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms