Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms