Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce1Q9D720 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms