Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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