Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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