Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms