Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms