Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zcchc13Q9D548 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms