Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms