Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms