Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D454 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D454 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D454 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D454 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D454 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms