Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpn3Q9D3W4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms