Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stag1Q9D3E6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms