Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc6bQ9D289 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc6bQ9D289 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc6bQ9D289 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc6bQ9D289 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc6bQ9D289 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trappc6bQ9D289 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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