Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms