Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms