Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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