Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ndc80Q9D0F1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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