Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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