Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms