Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms