Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim13Q9CYB0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim13Q9CYB0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim13Q9CYB0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim13Q9CYB0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim13Q9CYB0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim13Q9CYB0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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