Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms