Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx7Q9CY18 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms