Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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