Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms