Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Otud1Q9CUB6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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