Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard3bQ9CSB4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms