Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms