Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CR55 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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