Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms