Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms