Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms