Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb5Q9CQH3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms