Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms