Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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