Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc5Q9CQA1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms