Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms