Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms